Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGAT4CQ9UBM8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGAT4CQ9UBM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MGAT4CQ9UBM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4CQ9UBM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGAT4CQ9UBM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms