Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC17A7Q9P2U7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A7Q9P2U7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC17A7Q9P2U7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC17A7Q9P2U7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A7Q9P2U7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A7Q9P2U7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms