Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2L1Q9P0L9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2L1Q9P0L9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2L1Q9P0L9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2L1Q9P0L9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2L1Q9P0L9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2L1Q9P0L9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2L1Q9P0L9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms