Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACD3Q9P035 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD3Q9P035 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD3Q9P035 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HACD3Q9P035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD3Q9P035 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms