Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA4Q9NYJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COA4Q9NYJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COA4Q9NYJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms