Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TOR4AQ9NXH8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOR4AQ9NXH8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOR4AQ9NXH8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOR4AQ9NXH8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOR4AQ9NXH8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms