Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD1Q9NXG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD1Q9NXG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD1Q9NXG2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD1Q9NXG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms