Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAP2Q9NVZ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NECAP2Q9NVZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NECAP2Q9NVZ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NECAP2Q9NVZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECAP2Q9NVZ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms