Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR3EQ9NVU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3EQ9NVU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3EQ9NVU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3EQ9NVU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3EQ9NVU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms