Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACER3Q9NUN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACER3Q9NUN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACER3Q9NUN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACER3Q9NUN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACER3Q9NUN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER3Q9NUN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER3Q9NUN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER3Q9NUN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER3Q9NUN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms