Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EMILIN3Q9NT22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EMILIN3Q9NT22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EMILIN3Q9NT22 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EMILIN3Q9NT22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EMILIN3Q9NT22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EMILIN3Q9NT22 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EMILIN3Q9NT22 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EMILIN3Q9NT22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EMILIN3Q9NT22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms