Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RRP7BPQ9NSQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RRP7BPQ9NSQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RRP7BPQ9NSQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RRP7BPQ9NSQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.61■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
RRP7BPQ9NSQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RRP7BPQ9NSQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms