Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT82Q9NSB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT82Q9NSB4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT82Q9NSB4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT82Q9NSB4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT82Q9NSB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms