Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE3Q9NRF9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLE3Q9NRF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLE3Q9NRF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLE3Q9NRF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLE3Q9NRF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms