Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM8Q9NQV8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM8Q9NQV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM8Q9NQV8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM8Q9NQV8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM8Q9NQV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM8Q9NQV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM8Q9NQV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms