Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMRT3Q9NQL9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMRT3Q9NQL9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMRT3Q9NQL9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DMRT3Q9NQL9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DMRT3Q9NQL9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DMRT3Q9NQL9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMRT3Q9NQL9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMRT3Q9NQL9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DMRT3Q9NQL9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms