Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNB1IP1Q9NPC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNB1IP1Q9NPC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNB1IP1Q9NPC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms