Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20AQ9NP66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20AQ9NP66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMG20AQ9NP66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMG20AQ9NP66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms