Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC40A1Q9NP59 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC40A1Q9NP59 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC40A1Q9NP59 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC40A1Q9NP59 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms