Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVK-5Q9HDB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVK-5Q9HDB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERVK-5Q9HDB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVK-5Q9HDB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms