Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM3Q9HCF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRPM3Q9HCF6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM3Q9HCF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM3Q9HCF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM3Q9HCF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM3Q9HCF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRPM3Q9HCF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM3Q9HCF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms