Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRDE2Q9H7Z3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRDE2Q9H7Z3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRDE2Q9H7Z3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRDE2Q9H7Z3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms