Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSUN3Q9H649 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSUN3Q9H649 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN3Q9H649 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSUN3Q9H649 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSUN3Q9H649 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSUN3Q9H649 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms