Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD1Q9H3U5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MFSD1Q9H3U5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD1Q9H3U5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFSD1Q9H3U5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms