Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED28Q9H204 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED28Q9H204 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED28Q9H204 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED28Q9H204 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms