Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1BQ9H0U4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1BQ9H0U4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1BQ9H0U4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms