Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL25Q9H0H3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL25Q9H0H3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL25Q9H0H3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL25Q9H0H3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms