Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRTNQ9H040 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRTNQ9H040 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRTNQ9H040 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPRTNQ9H040 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRTNQ9H040 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms