Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP44Q9C0F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP44Q9C0F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP44Q9C0F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP44Q9C0F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms