Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CEP295Q9C0D2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP295Q9C0D2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295Q9C0D2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295Q9C0D2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295Q9C0D2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP295Q9C0D2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295Q9C0D2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms