Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CFAP74Q9C0B2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CFAP74Q9C0B2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CFAP74Q9C0B2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFAP74Q9C0B2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CFAP74Q9C0B2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CFAP74Q9C0B2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFAP74Q9C0B2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFAP74Q9C0B2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms