Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM4Q9C037 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM4Q9C037 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM4Q9C037 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM4Q9C037 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM4Q9C037 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM4Q9C037 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms