Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN6Q9BZV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN6Q9BZV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN6Q9BZV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN6Q9BZV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN6Q9BZV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms