Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXP3Q9BZS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXP3Q9BZS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXP3Q9BZS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXP3Q9BZS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXP3Q9BZS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms