Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM55Q9BYV6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM55Q9BYV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM55Q9BYV6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM55Q9BYV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM55Q9BYV6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM55Q9BYV6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms