Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC2Q9BYS8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC2Q9BYS8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC2Q9BYS8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRRC2Q9BYS8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC2Q9BYS8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC2Q9BYS8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRC2Q9BYS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms