Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF2Q9BWQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF2Q9BWQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF2Q9BWQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF2Q9BWQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms