Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC2Q9BWH2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FUNDC2Q9BWH2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FUNDC2Q9BWH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC2Q9BWH2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC2Q9BWH2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FUNDC2Q9BWH2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FUNDC2Q9BWH2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms