Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT27Q9BW83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT27Q9BW83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT27Q9BW83 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT27Q9BW83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT27Q9BW83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT27Q9BW83 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT27Q9BW83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT27Q9BW83 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT27Q9BW83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms