Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNB1Q9BVA0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNB1Q9BVA0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNB1Q9BVA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNB1Q9BVA0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms