Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRDL1Q9BU40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRDL1Q9BU40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRDL1Q9BU40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRDL1Q9BU40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms