Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC1Q9BTT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC1Q9BTT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC1Q9BTT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC1Q9BTT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC1Q9BTT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms