Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMM29Q9BSF4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM29Q9BSF4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMM29Q9BSF4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM29Q9BSF4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMM29Q9BSF4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMM29Q9BSF4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms