Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SDF4Q9BRK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDF4Q9BRK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDF4Q9BRK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDF4Q9BRK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SDF4Q9BRK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms