Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPIN3Q9BQK8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPIN3Q9BQK8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LPIN3Q9BQK8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPIN3Q9BQK8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms