Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SELENOSQ9BQE4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SELENOSQ9BQE4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOSQ9BQE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SELENOSQ9BQE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SELENOSQ9BQE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOSQ9BQE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms