Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECSITQ9BQ95 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECSITQ9BQ95 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECSITQ9BQ95 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECSITQ9BQ95 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECSITQ9BQ95 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECSITQ9BQ95 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECSITQ9BQ95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECSITQ9BQ95 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECSITQ9BQ95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECSITQ9BQ95 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECSITQ9BQ95 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms