Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOL4Q9BPW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOL4Q9BPW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL4Q9BPW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL4Q9BPW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms