Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VRK1Q99986 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRK1Q99986 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VRK1Q99986 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms