Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP4Q99727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP4Q99727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP4Q99727 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms